长春中医药大学研究生院是一所全日制研究生院，是以培养高层次中医药人才为目标的学院。其硕士学位授权领域为生物医学工程、中医学、中西医结合、药学等四个学科。博士学位授权领域为中医学、中西医结合和药学三个学科。
以中医药传承、创新、发展的重要位置为依托，研究生院致力于挖掘和发掘中医药及传统经典药物的研究价值，以及加快其现代化转化和产业化发展，推进中医药与现代医药的融合与创新。
研究生院采取“导师负责制”“招生、培养、管理、质量评估相结合”的管理模式，实行研究生导师、硕、博论文答辩等全英文教育，开设研究生创新设计课程和学术论文写作等实践课程，培养学生具备扎实的中医理论基础、较强的实践能力及创新思维意识。
长春中医药大学研究生院还加强与国内外高水平大学及科研机构间的联系和合作，积极推进中医药在国际学术界和临床实践中的应用和推广，努力打造成为国内外有影响力的学术研究机构。